يُقدّم مجلس مركز دبلوماسية المياه التوجيه الاستراتيجي والإشراف لضمان تحقيق المركز لمهمته المتمثلة في تعزيز التعاون الإقليمي في إدارة المياه وحوكمتها. ويجمع المجلس خبراء وقادة من الجهات الأكاديمية والحكومية والمنظمات الدولية لتعزيز الحوار والبحث وبناء القدرات.